接下来便是选举候补委员。候补委员具有列席军政委员会会议、参与重要问题决策的权利，但不具有实质性的决策权、投票权。
候补委员主要包括二级部的主官，守备师的主官，野战师的参谋长、复兴委员，重要条线负责人，各省、特别市的重要委员等。
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所谓一级部，是指党、政、军中比较重要的部门。譬如共和党的组织部、国民政府的外交部、革命军的参谋部，部长通常都是军政委员会正式委员。
所谓二级部，是指党、政、军中相对次要的部门。譬如国民政府的水利部、革命军的后勤部，部长通常是军政委员会候补委员。
本次党代会的特邀代表，如曾国荃、周秀英，都得任候补委员。
中午吃过饭，简单休息后，下午接着开会。
本次党代会的重头戏来了：选举产生共和党军政委员会委员长、共和国总统、革命军军事委员会主席。
共和国实行党、政、军一元领导，以维护中央权威，沿袭华夏集权传统。因此，共和党的委员长、共和国的总统、革命军的主席，将是同一个人。
毫无疑问，凭借在党、政、军的崇高威望，吴捷全票当选为委员长、总统、主席，在党称委员长、在政称总统、在军称主席。
党内，由委员长提名执委员成员，经军政委员会选举后，根据选举结果依法成立。选举采用等额选举，可以最大程度地保证选举结果。
新一届执行委员会仍由五人组成，吴捷继续担任主任，其余四人为李云、冯桂芳、史潘西、邹世安。
政府方面，由总统提名政务卿、最高检察长。政务卿总管共和国政府，位置非常紧要。吴捷起初最相中四个人，可作政务卿人选，分别是冯桂芳、史潘西、康可铨、倪云鹏。
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冯桂芳、史潘西资历、能力都够，却分别是陆军司令、海军司令，分身乏术。
康可铨能力可以，但长期偏居天京，在党内威望不够，对政府组织也不够熟悉。他还是江苏的一把手，也不能轻易调动。
倪云鹏能力也行，很有冲劲，就是太年轻，资历不够，此刻担任第二野战师师长。
再就是邹世安了。邹世安长期担任吴捷的副手，资历、威望都够，唯独能力一般，只能守成，不能创业。国民政府刚刚成立，凡事都要开拓创新。让邹世安担任政务卿，吴捷实在放心不下。
最后，吴捷思来想去，只得让李云担任政务卿。李云长期担任政工部长，论能力、论资历都够了。但她是吴捷的妻子，又是女性，颇令吴捷顾忌，担心别人说他任人唯亲。
但现在是用人之际，吴捷也顾不了那么多了，只得让李云担任政务卿。而且，这轮改革后，政工部要拆分成若干部门，分属党、政、军，李云不再担任政工部部长。
让一个女性担任共和国政务卿，可以充分彰显国民政府的开明，赢得洋人好感。
还有一件令吴捷深感棘手的事情：党内缺少资历足够、德高望重的法律人才，最高法院大法官难以补齐。
无奈之下，吴捷只得任命一个传教士、一个南洋华侨担任大法官。他们年纪都已超过六十，都在英国伦敦修习法律，专业、德行都没得说。
革命军方面，军事委员会的设置和选举相对简单，以吴捷为主席，另两名成员分别是陆军司令冯桂芳、海军司令史潘西，另有一个候补委员陆军参谋长卢波克。