１１６２年，完颜亮被杀，金世宗完颜雍即位。他对起义部队采取了劝降诱降、分化瓦解和调集兵力、严酷镇压相结合的政策。耿京领导的起义军，是他们重点镇压的目标。
面对这样的形势，辛弃疾力劝耿京取得南宋朝廷的支持，接受南宋朝廷的领导，与宋军配合作战。耿京即派辛弃疾等十一个人为代表，去和南宋朝廷联系。宋高宗在建康接见了他们，并任命耿京为天平军节度使，辛弃疾为天平军掌书记。
辛弃疾等人回山东复命，走到海州却听到了一个坏消息：耿京的部下张安国、邵进等人在金朝的收买下，杀死了耿京。起义军大部分溃散了，一小部分被张安国带去投降了金兵。张安国也被金兵任命为济州的知州。
辛弃疾既愤怒又悲伤，他立即约海州统制王世隆，带了五十名精锐人马直奔济州，捉拿张安国。到达济州的那天晚上，张安国正和金朝的将领在中军帐中喝酒。辛弃疾率众出其不意地闯进有五万金兵的大营，活捉了张安国。他还向金兵宣称：宋军十万人马即将开到，劝他们赶快投降。军中不少将士都是耿京的旧部下，听辛弃疾这么一说，当场就有上万人投到了辛弃疾一边，跟着他南下。张安国后来在临安被斩首示众。
辛弃疾的壮举在南宋朝野引起极大震动，不仅军民们非常敬佩，连宋高宗也连声赞叹。
此后，辛弃疾便留在了南方。他被朝廷派往江阴做官。江阴虽靠近前线，但在主和派的势力下，辛弃疾的抱负和才能根本无法施展。宋孝宗即位后，重用主战派的张浚，南宋王朝第一次主动出击。但张浚在符离大败，宋金签订了“隆兴和议”，主和派又占了上风。
尽管如此，辛弃疾仍向宋孝宗上奏了他的着名的《美芹十论》（又称《御戎十论》）。在文中，他分析了当时宋金双方的形势，从而提出了恢复中原的大计和克敌制胜的战略战术。但他的主张、建议都没引起朝廷的重视，这使他感到极大的悲愤和苦闷。这时期他写了不少词，大都是抒发自己报国无门、壮志难酬的不平和悲愤。
现实对辛弃疾是残酷的。他虽有出色的才干，但他的豪迈倔强的性格和执着北伐的热情，却使他难以在官场上立足。另外，“归正人”的尴尬身份也阻拦了他仕途的发展。使他的官职最高为从四品龙图阁待制。
从１１６８年起，辛弃疾先后到建康府、除州等地任职，后来又当过江西、湖南的安抚使，成了职位颇高的“封疆大吏”。可是主和派当道，他职位再高也实现不了杀敌报国的志向。他只能花力气整顿地方政府，并创办准备北伐的“飞虎军”。这又给主和派们抓到了把柄，公元１１８１年，他被主和派排挤，罢官回江西上饶的带湖闲住。
十多年后，直到宋光宗绍熙年间，他才又被起用，担任过福州知州、福建安抚使等职。不久又被罢官。公元１２０３年，他再度被起用，担任了绍兴知府、浙东安抚使等职。
在绍兴期间，他特地去拜会了年近八十的陆游。这对文坛骁将、抗敌志士喝酒做诗，相见甚欢。这年底，宋宁宗召辛弃疾去临安，征求军国大计。临行前，辛弃疾又去向陆游告别。陆游特地写了一首七言长诗为他壮行。诗中有“稼轩落笔凌鲍谢”，“青史英豪可雄跨”的句子，陆游称赞辛弃疾的词作超过南北朝的着名诗人鲍照、谢灵运，并且具有非凡的才能。陆游对这位文坛后起之秀给予了极高的评价。
辛弃疾有许多与陆游相似之处：他始终把洗雪国耻、收复失地作为自己的毕生事业，并在自己的文学创作中写出了时代的期望和失望、民族的热情与愤慨。在文学创作方面，他不像陆游喜欢写作诗歌尤其是格式严整的七律，而是把全部精力投入词这一更宜于表达激荡多变的情绪的体裁。如《破阵子·为陈同甫赋壮词以寄之》：
醉里挑灯看剑，
梦回吹角连营。
八百里分麾下炙，
五十弦翻塞外声，
沙场秋点兵。
马作的卢飞快，
弓如霹雳弦惊。
了却君王天下事，
赢得生前身后名，
可怜白发生！
朱熹病逝时，他的学说已被宣布为“伪学”。在当权者韩侂胃一派的压力下，许多朱熹的门人弟子不敢前往吊唁，而被朱熹“断过财路”的辛弃疾，却不畏禁令前往哭祭，并留下了一句留传千古的悼词：“所不朽者，垂万世名，孰谓公死？凛凛犹生！”
公元１２０５年三月，辛弃疾被任命为镇江知府。正当他积极备战时，朝廷却以他所推荐的官员有不法行为而把他连降两级，后来又把他罢了官。
开禧三年（1207年）秋，朝廷再次起用辛弃疾为枢密都承旨，令他速到临安府赴任。但诏令到铅山时，辛弃疾已病重卧床不起，只得上奏请辞。同年九月初十（10月3日），辛弃疾病逝，享年六十八岁。据说他临终时还大呼“杀贼！杀贼！”朝廷闻讯后，赐对衣、金带，特赠四官。