1942年11月，为加强地方武装建设，成立淮北军区。军区领导机关由第四师领导机关兼，司令员彭雪枫，政治委员邓子恢，参谋长张震，政治部主任吴芝圃。辖4个军分区。
1944年9月11日，在夏邑县八里庄的战斗中，彭雪枫英勇牺牲。张爱萍继任第四师师长和淮北军区司令员，韦国清任第四师副师长和淮北军区副司令员。
新四军第四师在抗日战争中坚持和发展了淮北抗日根据地，共歼敌6万余人，主力部队发展到万余人，还组建了地方武装万余。
第五师
转战鄂豫皖湘赣
1941年4月5日，豫鄂挺进纵队 1945年1月新四军五师主要领导合影改编为新四军第五师。师长兼政治委员李先念(后郑位三任政治委员)，参谋长刘少卿，政治部主任任质斌。辖第十三、第十四、第十五旅，第一、第二、第三游击纵队，以及豫鄂边区保安司令部，11月又组建了特务旅。第十三旅由原豫鄂挺进纵队第二、第三、第五团编成，并依次改番号为第三十七、第三十八、第三十九团。旅长周志坚，政治委员方正平，副旅长萧远久，参谋长黄霖，政治部主任栗在山。第十四旅由原豫鄂挺进纵队第一团、黄冈地方武装、第九团编成，并依次改番号为第四十、第四十一、第四十二团。旅长罗厚福，政治委员张体学，副旅长吴林焕，参谋长熊作芳，政治部主任夏农苔。第十五旅由原豫鄂挺进纵队第六、第十、第八团编成，并依次改番号为第四十三、第四十四、第四十五团。旅长王海山，政治委员周志刚，副旅长朱立文，参谋长张文津，政治部主任张执一。
第一游击纵队由原豫鄂挺进纵队第四团和第十团一部组成。司令员杨经曲，政治委员张执一，政治部主任王潜。辖第一、第三团。第五师师长李先念
第二游击纵队由原豫鄂挺进纵队第七团与信南地方武装编成。司令员黄霖，政治委员刘子厚，参谋长余学礼，政治部主任胡任伦。辖第四、第六团。
第三游击纵队由鄂东地方武装编成。司令员兼政治委员何耀榜。同年11月并入特务旅。
特务旅由第四十团和第三游击纵队编成。旅长罗厚福，政治委员兼政治部主任何耀榜。辖第一、第三团。1942年4月撤销番号。
第五师建立地方武装指挥机构，与其它师有所不同。一个不同是，早在1942年，就建立了5个军分区，但是直到1944年10月，才有鄂豫皖湘赣军区，统一领导各军分区。军区领导机关由第五师领导机关兼。
第五师活动于武汉四周，地跨鄂、豫、皖、湘、赣5省边区，长期远离军部，孤悬敌后，担负着独立坚持抗日游击战争，创建和发展鄂豫边抗日根据地的任务。新四军第五师在抗日战争中对敌作战1000余次，歼日伪军万余人，创建了鄂豫皖湘赣边区的广大抗日根据地，主力部队发展到万余人，组建了民兵30余万人。
第六师
坚持苏南阵地
1941年2月，新四军新四军第六师由苏南的新四军部队编成。师长兼政治委员和政治部主任谭震林，参谋长罗忠毅。辖第十六旅和第十八旅。第六师活动于西起南京、芜湖，东至淞沪，北濒长江，南抵天目山麓的苏南抗日根据地，战斗在日伪的心腹地区，担负着坚持苏南抗日
第六师师长谭震林游击战争的任务。
第十六旅由战斗在茅山地区的第二支队改编。旅长由罗忠毅兼，政治委员兼政治部主任廖海涛，参谋长王胜。辖第四十六、第四十七、第四十八团。
第十八旅由战斗在东路地区的第三支队改编。旅长是皖南事变中突围来到苏南的江渭清，政治委员温玉成，参谋长夏光，政治部主任张英。辖第五十二、第五十三、第五十四团。5月又组建了第五十一团。
第六师在抗日战争中经历了艰苦卓绝的反“扫荡”、反“清乡”斗争，始终坚持苏南阵地，直到抗日战争取得胜利。
第七师
燃起皖江烽火
1941年5月1日，新四军第七师由无为游击纵队、第三支队挺进团和皖南事变突围部队编成。师长张鼎丞(未到职)，政治委员曾希圣，参谋长李志高，政治部主任何伟。辖第十九旅和挺进团，共1900余人。同年11月，也是皖南事变突围的傅秋涛任副师长。第七师师长张鼎丞
第七师活动于东起江浦，西到岳西、宿松，南至太平、族德，北邻合肥，长江横贯于中的皖江抗日根据地，担负着坚持皖南和发展皖中、皖西抗日游击战争的任务。
第十九旅旅长孙仲德，政治委员曾希圣兼，参谋长林维先，政治部主任何伟兼。辖第五十五、第五十六、第五十七团。1942年2月，以挺进团与桐西独立团合编为第五十八团。
1943年3月，皖中军区成立。军区领导机关由第七师领导机关兼，领导人相同。此时，日军错误判断新四军军部已迁至皖中，因而对皖中地区实施了大规模的“扫荡”。为适应斗争需要，第七师实行主力地方化，将所辖部队和地方武装组建为4个支队和3个军分区。第七师为了打破日军和汪精卫政权的经济封锁，开展“贸易战“，设法与日汪地方政府达成协议用粮食换军用物资。
浙东游击纵队主要领导人，左二何克希第七师在抗日战争中浴血奋战，共歼日伪军2万余人，主力部队发展到2万余人，组建地方武装7000余人，坚持了皖中、皖南、皖西的抗日游击战争，向东沟通了与第二师、第六师的联系，向西沟通了与第五师的联系，巩固和发展了皖江抗日根据地。
浙东游击纵队
1943年12月22日，新四军军部命令三北游击司令部及所辖部队正式编为新四军浙东游击纵队。司令员何克希，政治委员谭启龙，参谋长刘亨云，政治部主任张文碧。辖第三支队、第五支队、金萧支队、浦东支队(后称淞沪支队)、三北自卫总队、四明自卫总队，以及教导大队、警卫大队、海防大队，共2300余人。第三支队支队长余龙贵，政治委员林达。第五支队支队长王胜，政治委员邱相田。金萧支队支队长蔡群帆，政治委员杨思一。浦东支队支队长朱亚民，政治委员姜杰。三北自卫总队总队长兼政治委员王耀中。四明自卫总队总队长罗白桦，政治委员刘清扬。