哈利用福灵剂终于完成了对斯拉格霍恩教授的调查，邓布利多也因此确认了伏地魔不死的秘密。这位对别人狠、对自己更狠的大反派已经把自己的灵魂分出了七份后分别存放在七件不同的物品中。只有将这七个魂器全部找出来并毁掉，才能彻底杀死伏地魔。
邓布利多甚至猜到了全部七件魂器的真相，但对于是否要告诉哈利他就是第七件魂器这件事情，善良的老人犹豫了。
除了邓布利多训练哈利，这个学期还发生了很多事情。
罗恩参加了魁地奇球队，还在福灵剂（伪）的帮助下神奇地获得了比赛的胜利，这让他再次膨胀，最后甚至根据混血王子的笔记调制出了迷情剂想给赫敏喝下，只是阴差阳错下被拉文德喝掉了，这个女孩本来就很喜欢罗恩，这次更在迷情剂的作用下扑倒了这个红发男孩……
在学期末的时候，罗恩被拉文德拉去霍格莫德村的帕笛芙夫人茶馆约会，但意外在猪头酒吧偷听到了小天狼星、卢平和他的父亲亚瑟的对话，小天狼星谈到克利切说出了挂坠盒的位置，雷古勒斯还为此付出了生命的代价，他认为应该立刻去夺取这件挂坠盒，但其余两人觉得这也可能是伏地魔的圈套，也许应该先告诉邓布利多。
罗恩得到情报后就立刻回学校找到了哈利，哈利已经知道了这个挂坠盒的重要性，他想立刻向邓布利多汇报此事，但罗恩却阻止了他。这个红发男孩此时已经仗着学霸笔记骄傲自大到目空一切了，他认为自己一个人就能干成这件事情，叫上哈利只是为了有个见证。甚至在他的心里，隐隐还有一个非常阴暗的想法……
哈利也觉得只是拿回挂坠盒并没有什么难的，而且他还在邓布利多的记忆里知道了那个孤儿院院长嘴里的海岛和山洞所在的位置。但他还想叫上赫敏，因为他坚持认为没有赫敏的话他们出去就会死。只是最后在罗恩的坚持下，哈利还是和罗恩两人偷偷溜出学校后幻影移形前往那个遥远的孤岛寻找挂坠盒。
在经历了一番冒险后，两人终于站在了盛放挂坠盒的玻璃容器前，但他们被这道最后的难关困住了，罗恩从混血王子的笔记里查到用来守护挂坠盒液体不能被触碰，不能被倒掉、分离、舀起和吸走，也不能被变形、施咒语和用别的方法来来改变它，只能用喝的，但喝的人会极端痛苦。
正当两人准备用猜拳决定谁来喝时，邓布利多教授赶到了现场。原来哈利最终还是留了一张纸条给教授，老教授赶来后决定自己喝下液体，他让哈利在旁边监视强迫自己喝下去。但哈利看到老人喝下液体后痛苦的样子，不忍心逼迫，反而是罗恩一次又一次地把液体灌进邓布利多教授的嘴里。
最终，邓布利多终于喝完了全部的液体，罗恩也成功拿到了挂坠盒。哈利在帮邓布利多从湖里舀水的时候，阴尸大军出现。罗恩看着哈利与阴尸搏斗没有帮忙，邓布利多教授拼尽全力施展了火神开道救了两人，并两次使用幻影移形把两人带回霍格沃茨的天文塔。
三人稍微休息了一下后，罗恩拿出挂坠盒，但他们发现挂坠盒已经被人调包过了，哈利责怪罗恩带来了错误的情报，因为这让邓布利多教授刚刚遭受的折磨显得毫无意义。
在两人吵起来时，虚弱不已的邓布利多教授突然有了预感，教授拉住哈利的手告诉他接下来的旅程要多依靠同伴，并告诉了他第七个魂器的真相。
哈利惊呆了，但他还是反应了过来，让罗恩帮忙照看教授后先用双面镜联系上小天狼星，把这里的情况告诉了他，然后想下天文塔去找麦格教授。
但哈利才下一层就遇到了埋伏起来的德拉科，德拉科再次把哈利用石化咒定住，还用隐身斗篷把他盖了起来后才上楼。
德拉科是奉伏地魔的命令来杀死邓布利多的，在这个学期里他已经进行了两次尝试，但无论是项链和毒酒都因为意外反而差点害死自己的同学。最后他终于修好了消失柜，成功将一队食死徒偷偷运入了霍格沃茨。在天文塔上，德拉科成功地对邓布利多使用了缴械咒，但面对已经失去魔杖并且虚弱不堪的邓布利多，德拉科发现自己始终无法下手给他致命一击，因为他的心中还存有仁慈和怜悯。
斯内普随后也来到了天文台，在邓布利多的请求下，他用阿瓦达索命杀死了老教授。
这时小天狼星和凤凰社的增援恰好赶到，他解除了哈利身上的石化咒，与同时抵达的食死徒打在了一起。
哈利在下面一层全程见证了邓布利多的死亡，他气疯了，不顾自己的实力去追杀已经离开的斯内普和德拉科，一直在旁边观战没有出手的罗恩也终于出手帮忙。但当斯内普承认自己就是混血王子时，罗恩目瞪口呆。在被凤凰社的成员包围前，斯内普带着德拉科逃走，而在一阵犹豫后，罗恩也跟着斯内普走了。
哈利不知道罗恩为什么会跟着斯内普走，也许那个红发男孩的内心很愧疚，邓布利多可以说是因为他的错误情报而死的，他不敢面对众人的指责。
最后，为邓布利多举行完葬礼后，同每年一样，哈利坐火车回家，过他在德思理家的最后一次暑假。只是这一次，铁三角已经不复存在，而几个月后也不再会有一位穿着古怪魔法袍的白发老人迎接他们的到来。