洪秀全、杨秀清、冯云山等保护老弱妇孺，全军辎重从大同江顺流而下前往永安。胡以晃和杨小山则率部夹江而行，在两侧护卫太平军的水路安全。藤县知县张鹏万见太平军这路老弱妇孺较多，想来占点便宜，率领团练在三江口意图阻击太平军。谁知被杨小山、胡以晃从两侧夹击，这位倒霉的张知县又被太平军的炮弹集中，落马负伤，得身边壮丁扶起背走，才捡回了一条小命。留下的团勇或被杀死或自逃走，自此水路再未有清军前来骚扰。十天后，洪秀全等人终于来到了永安城。
萧朝贵等人早就在永安恭候了，这几天他把那些勾结清妖的地方豪绅杀了，抄没了他们的家产，把大批的粮食衣物分给城里的穷苦乡亲。又把城里的监狱打开，释放了所有未作奸犯科的犯人，这些人成了太平军最忠实的拥护者，带领天兵搜寻还藏在城里未被抓获的清兵。
洪秀全坐在八抬大轿上威风凛凛地入了城，沿途护卫天兵，高喊“天兵专杀妖魔，绝不伤害百姓”，安抚所有还在观望的永安人。
永安原来的知府衙署被改造成了洪秀全的“天朝”，大堂五间，堂之前署两厢六房，托厦三间。又前为仪门，左为吏目署，右为礼拜堂。所有大堂、房舍和前署两厢，全用“黄纸裱墙”。各大堂门额，分别书写“天朝”、“二朝门”、“三朝门”、“四朝门”大字。大堂“内门涂黄，对画龙虎”。听取诸臣奏事的大厅，铺着红毡，厅前列花盆，处处张灯结彩。
天朝内还有龙虎四轮车一辆，由洪秀全专用，天朝大门的照壁，是太平天国颁布各种条规，诏令的地方。此刻上面就写着四赏四罚“带队归顺者有赏，探报妖情者有赏；捐献钱粮者有赏，输送军需者有赏。帮妖藏妖者必斩，凑勇反逆者必斩；**妇女者必斩，掳掠杀人者必斩。”
太平军虽入城不久，但已经初步安定了人心，太平军在一般百姓眼里并不是传说中会吃人的土匪，他们的军纪比清军都要好。原来的吴知府的人头在太平军入城后就宣布了他的几条大罪，包括镇压饥民等，他的人头挂在城门楼上，对所有还支持清廷的人是一种威慑。旧的权威被打倒了，太平天国新的权威在永安建立起来了。
精明的杨秀清没有让大军全进城，他观察了永安的地势，这座被群山包围的城市如果单单只守城池是无论如何都无法长期坚守的，他把主力分散在各个隘口，水窦，城外的莫村作为接应联络点，创造了一种主力部队守险，二线队伍守城的新战术。
杨小山没有被杨秀清安排在城外，因为之前立功太多，作为奖励他被接近城里让他多休息几天。在看到杨秀清的战术后，杨小山也不由得暗暗赞叹，不亏是军事天才，这样的防守战术，既牵制了清军对永安城的直接进攻，使得清军无法对永安形成合围，还保持了交通线和补给线的畅通，又可伺机机动出击，集中优势兵力，歼灭来犯之敌。这就好比强盗进村，大家不能等在家里让强盗杀，而是要埋伏在村子暗处，偷袭打闷棍，这样动态的防御更加有效。
在这样的防御体系下，永安足可坚持数月，清军短期是绝不可能打进来的。