随着剧情的深入，学校组织了一场生物实验课，教授向大家介绍道：“人类用了两百年的时间才研究出十六只超级蜘蛛。”
这句话引起了观众的好奇心，他们开始猜测接下来将会发生什么事情。
玛丽简由克尔斯滕邓斯特饰演将整个孵化箱翻了个底朝天，却仅仅发现了十五只。
这让所有人都意想不到，那只成功“越狱”的蜘蛛竟然就在他们的头顶之上。
“越狱”的超级蜘蛛在彼得帕克手掌狠狠地咬了一口，而此时大屏幕上正在播放着基因链条重组技术，仿佛在预示着某种重大的变革即将到来。
彼得帕克回到家中时，他感到头晕目眩，仿佛整个世界都在旋转。
第二天清晨，当他醒来时，整个世界都已经发生翻天覆地的变化，他的近视奇迹般地痊愈了，身体变得更加强壮，奔跑速度更快，感官也变得异常敏锐！
面对这些突如其来的身体变化，彼得帕克感到有些惊慌失措，不知该如何应对。
紧接着，经典的镜头再次重现，彼得帕克顺着墙壁爬上楼顶，在高楼之间轻盈地跳跃，发射出蛛丝在空中自由地荡来荡去！
深切地感受到身体的巨大变化后，彼得帕克为自己设计简陋版的蜘蛛战衣，并决定参加地下八角笼拳赛赚钱。
凭借超级蜘蛛改变的身体，彼得帕克轻松赢下拳赛。
与黑心老板拉扯，放跑抢劫犯都为剧情埋下伏笔，本叔叔被枪杀，彼得帕克心态发生巨大的转变。
本叔叔临死前，说过的那句“能力越大，责任越大”的话，如同烙印一般深深地刻在了彼得帕克的心中。
从那以后，他决心用自己的力量来保护这座城市，于是彼得帕克开始优化蜘蛛侠战衣，时刻准备着协助警方打击犯罪。
直到奥氏公司年会这天，原本平静的生活彻底被打破。
好友哈里的父亲诺曼奥斯本化身成绿魔，残忍地杀害了那些试图让他出局的公司高层人员。
蜘蛛侠与绿魔初次交手，两人难分胜负。
幸运的是，彼得帕克最终成功救下了玛丽简！
电影的结局总是充满戏剧性，正义最终战胜了邪恶，绿魔被自己的飞行器无情地杀死。
但最好的朋友哈里，却永远失去了他的父亲。
哈里发誓要为父亲报仇，甚至亲手杀死蜘蛛侠。
看着哈里痛苦的模样，彼得帕克不禁陷入了沉思，开始怀疑自己的选择是否正确。
蜘蛛侠的身份让他不得不面对现实，他只能拒绝女神的示爱，因为他担心自己的身份，会给身边的人带来危险和伤害。