随后卫队士兵开始斩杀家中的佣人和随从，并且大声喊叫：“抓住女巫和那个生病的孩子，她们与恶魔签订了契约，其余的人统统杀光。”艾米西亚和母亲在佣人的帮助下，从后门逃出了教皇卫队的魔爪。在野外，她们看到数不清的老鼠洞，和被啃食殆尽的牲畜以及人类的遗骸。母女二人逃到自己领地管辖的城镇，发现这里每一户居民的家门上都被画上了大大的叉，二人偷偷来到城镇的广场，她们看到士兵正在屠杀手无寸铁的居民，并且焚烧他们的尸体。艾米西亚的母亲意识到，为了防止黑死病的传播，教会已经开始派军队残杀老鼠侵袭过的城镇百姓，于是她带着女儿逃向了荒野。
在荒野之上，她们看到了另一幕人间地狱。英法百年战争持续了一百一十六年，当时在战场上铺满了英军和法军的尸体，死尸已经遍布大地，多到已经看不到土地和杂草，映入眼帘的只有一望无际的尸海。因为老鼠畏光，所以在阳光明媚的白天不出来活动，但是到了晚上或者阴雨天，这些尸体就成了老鼠享用不尽的餐食，有了食物的保障，老鼠的繁衍也越来越快，不久已经变得无处不在。艾米西亚和母亲靠着火把躲避老鼠，跨过重重尸山血海，几经辗转，终于搭船跨过英吉利海峡逃到大陆，在一处偏僻的村庄躲了起来。
艾米利亚和母亲逃到大陆的一个偏僻村庄安顿下来。在这里没有人认识她们，而且这里偏僻荒凉，还没有被鼠疫侵袭。母亲配制药剂为村人治病，艾米西亚用父亲教给自己的技术用投石器打猎，同时也跟随母亲学习炼金术。就这样母女二人平静地生活了三年。三年之后，鼠疫终于蔓延到这个偏僻的小村庄，母亲努力制作药剂缓解黑死病给病人带来的痛苦，可是收效甚微，大批的村民死去，整个欧洲大陆被笼罩在黑死病的阴影当中。
此时教会担心，黑死病的肆虐和连年战争会动摇信徒们对上帝的信仰，由此导致神权弱化。于是他们编造谎言，将黑死病的原因归结于女巫。教会宣称女巫和恶魔缔结契约使用巫术残害生灵，这种行为触怒了上帝，所以上帝才会让鼠疫发生用以惩罚人类，只有杀光女巫，人类才能获得救赎。在罗马教皇英纳森八世的一声令下，整个欧洲大陆掀起了猎杀巫女的热潮。在对上帝的信仰以及对黑死病的恐惧的双重作用下，没有任何科学意识的民众，毅然决然地选择了相信教会的决定。而当时对于一个女人是否是女巫的判定上，只有一个必要条件：有人告发你是女巫，那么你就是女巫。一经发现，人民有自主处置女巫的权力，不需要经过教会的监督和批准。就是在这样残忍至极、荒谬至极的命令下，数十万无辜女性成为了宗教的祭品和替罪羊。艾米西亚的母亲本就是炼金术士，自然逃不过这场浩劫。
此时，艾米西亚的母亲通过几个月的研究和临床试验，已经可以制作出有效抑制黑死病的药剂，只需要再加以改进就能完全治愈黑死病。就在母女二人为此欢欣雀跃的时候，她们家的房门被撞开，随即大批的村民涌进家中，将艾米西亚和母亲绑了起来。村民们将艾米西亚和母亲绑在十字架上，在她们的脚下堆满了柴火。有人告发艾米西亚的母亲是女巫使用巫术制造药物，所以村民们决定烧死她们母女二人。艾米西亚气愤地大喊：“我母亲用的不是巫术，是科学。你们这些人哪一个生病了不是吃我母亲的药才好的，我母亲已经研制出了可以治疗黑死病的药，很快大家就有救了，你们要相信我！”手举火把的村民们都低下头不说话，在村长的一声命令下，他们点燃了艾米西亚母亲脚下的柴火，母亲对艾米西亚说的最后一句话是：“好好活着！”艾米西亚亲眼看着自己的母亲被熊熊烈火烧死，这时她的血液病再次发作，她感觉自己浑身的血液好像沸腾了一样，红色的血线像一条条小蛇爬上了她的颈部。就在村民点燃艾米西亚脚下柴火的瞬间，艾米西亚的能力终于觉醒了。
只见无数老鼠从暗处涌出，本应该怕火的老鼠们，居然层层叠叠地堆积起来，好似平地而起的旋风一样，扑向艾米西亚脚下的火堆，它们用自己的身体压在火堆上将火压灭，又有老鼠爬上十字架，咬断绑住艾米西亚的绳子。艾米西亚走下柴火堆，她的周围环绕着大批的老鼠，好像在等候她的命令。村民们被眼前的一幕惊呆了，这时村民之中传来了声音：“教皇没有骗我们，真的是女巫干的好事，你们看她能够操纵老鼠，杀了她！”村民们举着火把和武器冲向艾米西亚，此时艾米西亚的眼睛已经完全变成了红色，她的脸颊上流淌着两行血泪。她的手一挥，大批鼠群扑向村民，先冲上来的老鼠用身体扑灭村民手中的火把，接下来又有更多的老鼠扑到村民身上，瞬间村民的身体就化为白骨。最后艾米西亚跨过村民的尸体，看向宗教审判所的方向说道：“我要杀死所有人类！”这就是十恶——嗔恚的诞生。